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你可以通过设置“”这个文件来自定义键盘的快捷方式。在这个文件里面定义的快捷方式会覆盖掉原有默认的快捷方式。另外，这个文件也可以被用来覆盖掉原有的技巧提示。修改这个文件的工具你可以用记事本之类的文本编辑软件。一旦在安装目录中创建了这样的一个自定义文件。那么游戏选项中的"自定义键"就应该被设置成开启的状态，这样《魔兽争霸3》才会自动读取这个快捷方式自定义文件。
热键自定义
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总体上来说，键盘上的以下一些快捷方式是可以被自定义的：
- Hotkey
- Unhotkey
- Researchhotkey
自定义的快捷键必须是大写的。
很多动作有很多的快捷方式相关。（比如，一个近战武器的升级可能会涉及到三次升级，这样每次升级的快捷键可能都是不一样的。）一个很好的例子就是，对于人类近战武器的升级，三次升级的快捷键可以分别是：
[Rhme]
Hotkey=X,Y,Z
其他动作对于激活和反激活有着不同的快捷键。（比如，步兵的防御技能。）这样，对于步兵的防御技能，激活和反激活的快捷键可以被设定成：
[Adef]
Hotkey=A
Unhotkey=B
对于英雄的技能，快捷键是通过一个名字叫做Researchhotkey的条目来显示。比如，圣骑士的复活技能的快捷键就可以是：
[AHre]
Researchhotkey=U
注意，如果在同个单位上，相同的快捷键被分配在了多个动作上，那么《魔兽争霸3》还是可以正常运行的。但是，只有一个和相应快捷键相关的动作会被执行。您也要注意到，很多动作会被很多单位都使用到，这样也就意味着在不同的单位之间可能还会发生快捷键的冲突。
按钮位置的自定义
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以下的一些按钮位置条目可以被自定义：
- Buttonpos
- Unbuttonpos
- Researchbuttonpos
单位的命令面板上的按钮位置也可以被自定义。位置是用x，y坐标来表示的。x=0表示的是表示最左边的按钮列，而x=3表示最右边的按钮列。y=0是最上面的按钮行，y=2是最下面的按钮行。比如，一个训练兽人步兵的按钮如果出现在命令面板的最右列中间一行，那么它的位置信息看上去就应该是这样的：
[ogru]
Buttonpos=3,1
注意，如果对于同一个单位，两个动作按钮被设置在了同一个位置，那么《魔兽争霸3》会试图来调整其中一个的位置。但是，如果程序不能自动来重新设置该按钮的位置的话，那么该按钮就不会出现在面板中。这样，该动作按钮就会变成不可用的了。同时你也要注意，很多单位是使用相同的技能，所以即使在同一个单位内没有出现按钮位置重叠的情况，那么这种情况也可能会发生在不同单位之间。因此，在自定义按钮位置的时候应该要小心一些。所有后果由玩家自负。
